A légkondicionáló berendezések eredetileg nemcsak a forróság megszüntetésére hivatottak: képesek eltávolítani a párát is a levegőből, és az allergiát okozó anyagokat is majdnem olyan jól kiszűrik, mint a legtöbb légtisztító készülék. Az egészségre gyakorolt hatásuk tehát nem káros, ellenkezőleg: kifogástalan. Más a helyzet, ha a készülék régi, nincs karbantartva a szűrője, és még soha nem volt tisztítva. Ezekben az esetekben ugyanis többet árthat, mint használ.
A klímák nem minden esetben okoznak asztmát, csak akkor, ha nincsenek megfelelően karbantartva. Az elhanyagolt, piszkos szűrő ugyanis a pollenek, gombák, penészspórák és baktériumok melegágya, ami asztmarohamot okozó allergéneket, a szem, az orr és a torok izgalmát, sőt, influenzaszerű megbetegedéseket okozó mikroorganizmusok millióit juttathatja a szoba légterébe. Megfelelő karbantartással azonban minimálisra csökkenthető ez a veszély.
A nagy épületek légkondicionáló berendezései valóban komoly veszélyt jelenthetnek, mert ezek víztartályaiban elszaporodhatnak a kórokozó baktériumok. Amikor Philadelphiában az Amerikai Légió 1976-os kongresszusának résztvevőinél járványos tüdőgyulladás lépett fel, a kutatók kimutatták a halálos kórokozót a szálloda levegőjében, melyet a légkondicionáló-rendszer keringetett. Az újonnan felfedezett kórokozó neve Legionella pneumophila lett, innen a legionárius betegség elnevezés. Csakhogy ezek is kizárólag olyan helyen tudnak elszaporodni, ahol egyáltalán nem tartják karban a szellőzőrendszert, és a légkondicionálók szűrőjét sem tisztítják. Halált pedig még kevesebb esetben okoznak ezek a kórokozók, csak extrém esetben és túlérzékenység esetén.
Ez méretezés kérdése. Ha egy lakás 10 kW fűtési teljesítményt igényel, és ez biztosítva van klímával, akkor az a lakás ugyanúgy megfelelően fel lesz fűtve, mint bármely más megoldással.
Amikor a berendezést használat után leállítják, akkor a beltéri egység addig hideg hőcserélőjének hőmérséklete fokozatosan emelkedik, elérve a helyiség hőmérsékletét. Mivel ez a hőcserélő működés közben kondenzált, tehát a magán átkeringetett levegő páratartalma a hideg felületen kicsapódott, leállítás után önmagától nem tud kiszáradni, a hőmérséklete pedig szoba-hőmérsékletű Így ez a felület tökéletes táptalaja az úgynevezett legionella baktériumtörzsnek, amely A-típusos tüdőgyulladáshoz vezet. Ezért nagyon fontos, hogy saját egészsége érdekében rendszeresen tartassa karban berendezéseit, hogy egészsége a későbbiekben se lássa kárát komfortérzetének. A legoptimálisabb időpont a tavaszi-nyári első beindítást megelőző időszak, mivel ilyenkor a téli üzemen kívüli időszakban a gépbe lerakódott kb. féléves port, és a kialakult baktériumtelepeket az első beindítást követően a ventilátor mind a helyiség légterébe fújja, amit a bent tartózkodók tudtuk nélkül belélegezhetnek. Jobb esetben érzik, hogy valami nagyon kellemetlen szag terjeng a levegőben, és esetleg allergiás tünetek is jelentkezhetnek.
Klímaberendezést csak megfelelő szakképzettséggel és érvényes, fényképes "zöldkártya" igazolással rendelkező szerelő telepíthet, különben a készülékre a gyártó által adott garancia nem érvényes.
